扶贫办修公路毁庄稼应补偿。依据《土地管理法》，征收需先补偿后开工，否则违法。不补偿可能导致农民权益受损，影响生产生活。
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此问题可通过协商或诉讼解决。建议先与扶贫办、村委会协商，寻求合理补偿；协商无果时，可向法院提起诉讼，维护自身权益。
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扶贫办应补偿。操作如下：1. 收集证据，如庄稼毁坏照片、修路前后对比等；2. 与扶贫办、村委会沟通，提出补偿要求；3. 若协商不成，咨询律师，准备法律材料；4. 必要时向法院起诉，要求赔偿损失。